weather 21.1°
$ 71.91
82.97

Главная / Коронавирус / Ученые СПбГУ создали модуль для расшифровки геномов коронавирусов

Ученые СПбГУ создали модуль для расшифровки геномов коронавирусов

Центр алгоритмической биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета (СПбГУ) создал модуль, позволяющий расшифровывать геномы коронавирусов, сообщает пресс-служба вуза.

«Новая разработка Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ, получившая название coronaSPAdes, позволяет собирать геномы РНК-вирусов, и в первую очередь коронавирусов. По предварительным данным, с ее помощью уже удалось восстановить последовательности геномов ранее неизвестных коронавирусов», - говорится в сообщении.

Модуль coronaSPAdes - это специальный режим сборщика SPAdes (Saint Petersburg Assembler), который позволяет производить расшифровку геномов живых организмов, в том числе и вирусов.

Как отмечает СПбГУ, модуль coronaSPAdes учитывает особенности данных секвенирования РНК, а также реализует уникальные алгоритмические решения, нацеленные на улучшение восстановления последовательности генома коронавирусов. Подходы, заложенные в coronaSPAdes, могут быть использованы в дальнейшем для разработки новых сборщиков, использующих информацию о структуре иных типов геномов.

Разработка первой версии этого модуля заняла около двух недель, и сейчас его создатели занимаются усовершенствованием сборщика. По их оценке, модуль coronaSPAdes позволяет восстанавливать геномы коронавирусов «гораздо эффективнее и качественнее, чем альтернативные подходы».

«Например, из некоторых наборов данных были собраны полноразмерные геномы, по предварительным данным, ранее неизвестных коронавирусов», - информирует университет.

Вам будет интересно
"Опять двойка" или как провалились митинги коммунистов в Ленобласти
Известная советская картина вспоминается при виде протестных мероприятий, которые в очередной раз организовали в Ленобласти коммунисты. Помните, н...

Ранее американские учёные выявили шесть основных групп SARS-СoV-2, в настоящий момент циркулирующих в мире. Исследователи разработали алгоритм, позволяющий быстро выделить последовательности геномов, и использовали его для изучения более 10 тысяч образцов SARS-СoV-2 из разных регионов мира.

Спасатели эвакуировали мужчину без сознания с острова в акватории Вуоксы

Мужчину без сознания обнаружили на острове Снегирь в акватории озера Вуокса. На помощь пострадавшему выехали сотрудники поисково-спасательного отряда города Приозерск.

Спасатели доставили мужчину с острова на берег и передали бригаде скорой помощи. Состояние пострадавшего уточняется.

Вам будет интересно
Мужчина утонул в реке Волхов
Тело неизвестного мужчины обнаружили в реке Волхов 14 июня. Очевидец заметил погибшего в воде и сообщил об этом в Аварийно-спасательную службу Ленингр...

×
Самое интересное – у нас в ТГ. Подписывайтесь
подписка в телеграм Подписаться