Ученые СПбГУ создали модуль для расшифровки геномов коронавирусов

Центр алгоритмической биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета (СПбГУ) создал модуль, позволяющий расшифровывать геномы коронавирусов, сообщает пресс-служба вуза.

Модуль coronaSPAdes - это специальный режим сборщика SPAdes (Saint Petersburg Assembler), который позволяет производить расшифровку геномов живых организмов, в том числе и вирусов.

Как отмечает СПбГУ, модуль coronaSPAdes учитывает особенности данных секвенирования РНК, а также реализует уникальные алгоритмические решения, нацеленные на улучшение восстановления последовательности генома коронавирусов. Подходы, заложенные в coronaSPAdes, могут быть использованы в дальнейшем для разработки новых сборщиков, использующих информацию о структуре иных типов геномов.

Разработка первой версии этого модуля заняла около двух недель, и сейчас его создатели занимаются усовершенствованием сборщика. По их оценке, модуль coronaSPAdes позволяет восстанавливать геномы коронавирусов «гораздо эффективнее и качественнее, чем альтернативные подходы».

Ранее американские учёные выявили шесть основных групп SARS-СoV-2, в настоящий момент циркулирующих в мире. Исследователи разработали алгоритм, позволяющий быстро выделить последовательности геномов, и использовали его для изучения более 10 тысяч образцов SARS-СoV-2 из разных регионов мира.

Врачи предостерегли от употребления слишком горячих напитков.

Употребление чрезмерно горячих напитков чревато серьезными долгосрочными последствиями для здоровья. Как пишет «Доктор Питер» со ссылкой на недавние исследования, такая пищевая привычка способна утроить вероятность развития рака пищевода.

В ходе научной работы эксперты проанализировали показатели 977 282 участников. Исследователи собирали информацию о предпочтительной температуре напитков у респондентов, а затем в течение десятилетия наблюдали за состоянием здоровья добровольцев, фиксируя случаи онкологии.

За время наблюдений диагноз был поставлен 2348 участникам, среди которых 1046 случаев пришлось на плоскоклеточный рак, а 1303 — на аденокарциному.

Выяснилось, что пристрастие к обжигающим кофе или чаю напрямую коррелирует с развитием плоскоклеточного рака пищевода. У любителей горячего риск возрастал в три раза по сравнению с теми, кто предпочитал напитки умеренной температуры.

При этом важен и объем потребления. Те, кто выпивал шесть и более чашек горячего в день, сталкивались с риском развития болезни на 71% чаще.

Стоит отметить, что ученые опирались на субъективные оценки участников, не прибегая к точным температурным замерам, поэтому конкретный порог опасности не был установлен. Еще в 2016 году Международное агентство по исследованию рака (IARC) — онкологическое агентство ВОЗ — классифицировало употребление напитков с температурой выше 65 градусов как потенциальное опасное.

Аналогичные выводы были получены иранскими учеными. У тех, кто ежедневно выпивал около 2-3 кружек очень горячего чая (от 60 °C), риск возникновения рака пищевода возрастал на 90%.

Фото: magnific