Ученые СПбГУ создали модуль для расшифровки геномов коронавирусов

08:42 07.07.2020

Центр алгоритмической биотехнологии Санкт-Петербургского государственного университета (СПбГУ) создал модуль, позволяющий расшифровывать геномы коронавирусов, сообщает пресс-служба вуза.

«Новая разработка Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ, получившая название coronaSPAdes, позволяет собирать геномы РНК-вирусов, и в первую очередь коронавирусов. По предварительным данным, с ее помощью уже удалось восстановить последовательности геномов ранее неизвестных коронавирусов», - говорится в сообщении.

Модуль coronaSPAdes - это специальный режим сборщика SPAdes (Saint Petersburg Assembler), который позволяет производить расшифровку геномов живых организмов, в том числе и вирусов.

Как отмечает СПбГУ, модуль coronaSPAdes учитывает особенности данных секвенирования РНК, а также реализует уникальные алгоритмические решения, нацеленные на улучшение восстановления последовательности генома коронавирусов. Подходы, заложенные в coronaSPAdes, могут быть использованы в дальнейшем для разработки новых сборщиков, использующих информацию о структуре иных типов геномов.

Разработка первой версии этого модуля заняла около двух недель, и сейчас его создатели занимаются усовершенствованием сборщика. По их оценке, модуль coronaSPAdes позволяет восстанавливать геномы коронавирусов «гораздо эффективнее и качественнее, чем альтернативные подходы».

«Например, из некоторых наборов данных были собраны полноразмерные геномы, по предварительным данным, ранее неизвестных коронавирусов», - информирует университет.

"Опять двойка" или как провалились митинги коммунистов в Ленобласти

Известная советская картина вспоминается при виде протестных мероприятий, которые в очередной раз организовали в Ленобласти коммунисты. Помните, н...

Ранее американские учёные выявили шесть основных групп SARS-СoV-2, в настоящий момент циркулирующих в мире. Исследователи разработали алгоритм, позволяющий быстро выделить последовательности геномов, и использовали его для изучения более 10 тысяч образцов SARS-СoV-2 из разных регионов мира.

Анна Васильева

Теги

Новости Социум

Более 50% опрошенных россиян не получали недвижимость в наследство

21:15 14.06.2026

Об этом свидетельствуют результаты опроса, результаты которого оказались в распоряжении ТАСС.

Порядка 60% россиян не получали жилье в наследство от родственников, заявили в компании «Гранель» по итогам опроса 2322 респондентов.

«Квартира от родителей или родственников для многих остается одним из самых сильных вариантов семейной поддержки. Но такой сценарий доступен далеко не всем: по данным исследования, 59% россиян никогда не получали недвижимость в наследство или в подарок от близких», — указано в сообщении.

Тем временем только 27% опрошенных заявили, что получили жилье по наследству. Еще 10% россиян заявили, что недвижимость им подарили.

Оплатить майский счет за услуги ЖКХ можно до 15 июня

Россияне могут оплатить счета за жилищно-коммунальные услуги за май до 15 июня. Об этом сообщил зампред комитета Госдумы по строительству и ЖКХ Сергей...